Cvijeće za Algernona je dirljiva priča o čovjeku po imenu Charlie, odabranom za eksperiment koji mu nudi priliku da postane "pametan", što je njegova najdublja želja u životu. Roman postavlja nekoliko važnih tema i pitanja, uključujući etiku eksperimentiranja s ljudima, loše postupanje s mentalno poremećenima u društvu i odnos između intelekta i ljudskih interakcija.
Prije je bilo nešto u tebi: toplina i otvorenost, ljubaznost koja je svima poput vas učinila. Sada...
MAN vs SAMO
Povuče Charlie Gordon opet, ha, Charlie?
MAN vs DRUŠTVO
Charlie i Alice se međusobno suprotstavljaju kad se konačno ljuti na promjenu Charliejevog stava. Kaţe mu da se promijenio i izgubio je osobine koje su mu se svidjele. Charlie reagira u srdžbi jer se osjeća kao da svi očekuju da će ostati isti kako bi ga mogli nastaviti liječiti okrutnošću.
Charlie se osjeća kao da ga gleda "Charlie", njegova samostalna verzija. Kaže da ne možete postaviti novu zgradu bez uništavanja stare, a starija verzija Charlie prekida svoje misli i dolazi između odnosa i iskustava koje pokušava razumjeti.
Radnici u pekari tretirati Charlie drugačije prije i poslije operacije. Prije operacije, zaposlenici Joe, Frank i Gimpy zlobno zadirkivali Charlie i vidjeli ga kao metu za svoje pjege i šale. Jednom kad Charliejeva inteligencija raste, međutim, počnu ga se bojati jer ne razumiju tu promjenu. Prestaju razgovarati s njim i postati otvoreno neprijateljski prema njemu.